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WP-4 Traitement d'images multidimensionnelles
Vu les données produites dans les WP1 et 2 ou requises par les modèles et les simulations du WP5, le WP4 a deux principaux objectifs: améliorer le processus de formation de l'image dans des imagerie émergentes et extraire des indicateurs et des biomarqueurs d'imagerie pertinents afin d'améliorer le diagnostic et la thérapie dans des applications médicales ciblées.
Le traitement des données est une étape importante pour la qualité de reconstruction de l’image à partir divers systèmes de production d'images. Les développements conduits dans le WP4 visent à améliorer la formation de l’image dans un certain nombre de modalités d'imagerie où le déficit de mesures peut-être important (données parcimonieuses). Il s'agit notamment de développer de nouvelles techniques de reconstruction d'images (échantillonnage compressé, reconstruction sous contrainte, optimisation stochastique), de proposer de nouvelles formules d'inversion et de nouveaux schémas de reconstruction pour des imagerie émergentes (Tomodensitométrie à rayons X de phase, tomodensitométrie spectrale, tomographie optique de fluorescence, imagerie Compton pour la Hadronthérapie) et de développer des méthodes génériques pour traiter divers types de bruit.
Les objectifs de diagnostic et de thérapie conduisent à élaborer des méthodes d’extraction de paramètres des images et de proposer de nouveaux indicateurs et bio-marqueurs relatifs aux pathologies ciblées. La détection robuste et (semi-)automatique de structures ou d'évènements élémentaires des images reste un problème ouvert, compte tenu des multiples niveaux d'incertitude des données d'imagerie (données éparses et bruitées notamment). Il s'agit d'étudier de nouvelles représentations adaptées à des données pouvant être scalaires, vectorielles, tensorielles, quaternioniques (modèles discrets combinatoires multi-résolution pour des image 3D et les maillages, opérateurs pour l'algèbre de Clifford et multi-quaternionique, signal analytique nD, analyse fractale et multi-fractale), d'étendre en multi-dimensions des opérateurs pour la segmentation (ensembles de niveaux statistiques, basés atlas, graph-cuts), l'estimation multi-paramétrique, le recalage et l'estimation de mouvement (basés sur la phase, sur le transport optimal et sous optimal). Plusieurs aspects des systèmes d'aide à la décision (approches supervisées/non-supervisées, paramètres hétérogènes, stratégies de validation) font également partis de nos travaux.
Les développements conduits dans le WP4 sont appliqués plus particulièrement en imagerie cardiovasculaire, cérébrale, de l’os et pour le traitement du cancer guidé par l’image.
Thèses PRIMES portant sur les thématiques du WP4:
- Alina TOMA 2012-2015 - Joint super-resolution/segmentation approaches for the tomographic images analysis of the bone micro-architecture
- Denis BUJOREANU 2015-2018 - Echographie compressée : une nouvelle stratégie d'acquisition et de formation pour une imagerie ultra-rapide
- Mathilde GIACALONE 2014-2017 - Traitement et simulation d’images d’IRM de perfusion pour la prédiction de l’évolution de la lésion ischémique dans l’accident vasculaire cérébral
- Meriem El Azami 2013-2016 - Computer aided diagnosis of epilepsy lesions based on multivariate and multimodality data analysis
- Nathan PAINCHAUD 2020-2023 - Apprentissage profond de variétés pour une meilleure caractérisation de l’hypertension artérielle en imagerie échocardiographique
- Nolann LAINE 2021 - 2024 - Analyse structurelle et cinématique de la paroi artérielle, dans les séquences d’images échographiques, par apprentissage profond
- Sarah LECLERC 2016-2019 - Automatisation de la segmentation sémantique de structures cardiaques en imagerie ultrasonore par apprentissage supervisé
- Sébastien CROMBEZ 2019-2022 - Hyperspectrale compressive imaging by deep convolutional neural network
- Sophie CARNEIRO-ESTEVES 2020-2023 - Segmentation des vaisseaux sanguins par approche variationnelle et apprentissage profond
- Tom HOHWEILLER 2016-2019 - Méthodes de décomposition non-linéaire pour l'imagerie X spectrale
- Yunyun SUN 2018 - 2021 - Patient-based color Doppler echocardiographic simulation
Responsables du WP-4
Michaël SDIKA, laboratoire CREATIS (Lyon)
Fabien MOMEY, laboratoire LabHC (Saint-Etienne)